Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb2Q00977 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms