Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SeleQ00690 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SeleQ00690 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms