Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms