Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms