Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms