Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ptprn2P80560 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptprn2P80560 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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