Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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