Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms