Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms