Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ext2P70428 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms