Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms