Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms