Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo4P61969 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo4P61969 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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