Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf3P61205 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf3P61205 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms