Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NcstnP57716 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms