Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcd5P56812 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms