Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CckbrP56481 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CckbrP56481 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms