Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtskP55097 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtskP55097 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtskP55097 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms