Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms