Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms