Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfP51642 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfP51642 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfP51642 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms