Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa6P50704 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms