Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cav1P49817 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cav1P49817 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms