Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox8bP48772 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms