Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prox1P48437 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms