Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VdrP48281 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VdrP48281 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VdrP48281 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VdrP48281 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VdrP48281 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VdrP48281 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms