Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl5P47962 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl5P47962 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms