Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms