Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stt3aP46978 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stt3aP46978 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms