Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo1bP46735 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo1bP46735 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms