Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InaP46660 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InaP46660 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InaP46660 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InaP46660 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InaP46660 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InaP46660 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
InaP46660 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms