Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms