Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms