Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ThpoP40226 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms