Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms