Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik2P39087 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms