Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms