Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sftpa1P35242 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sftpa1P35242 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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