Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms