Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim2P33610 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms