Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms