Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc1P29341 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms