Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxrgP28705 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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