Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms