Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms