Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CftrP26361 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CftrP26361 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CftrP26361 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CftrP26361 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CftrP26361 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CftrP26361 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CftrP26361 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CftrP26361 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CftrP26361 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CftrP26361 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CftrP26361 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CftrP26361 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CftrP26361 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CftrP26361 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CftrP26361 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CftrP26361 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CftrP26361 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms