Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ChgaP26339 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms