Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd19P25918 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd19P25918 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd19P25918 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms