Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NdnP25233 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NdnP25233 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NdnP25233 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms