Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms